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一、财税 【2016】36号文《关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》附件1中关于销售服务、无形资产、不动产注释对劳务派遣税目是这样规定的：
文件中这样定义报关代理服务：是指接受进口货物的收、发货人委托，代理办理报关手续的业务活动。
二、税率
一般纳税人适用6%税率，可以抵扣进项税。
小规模纳税人适用3%征收率，不可以抵扣进项税。
三、报关代理业务的特殊性
报关代理有其特殊性，比如代理进口，它往往是和货物的报关联系在一起，而代理方不可避免的会存在向海关支付进口货物增值税、消费税、关税、向外商支付货款的情况、向委托方收取这部分费用的情况。这就是我们通常所说的“代收代付”。
“代收代付”在报关代理服务中是不可分离的，这其实主要源于多方面的原因。
比如，委托方不会单独再与国外供应商发生任何资金往来，也不愿意和海关发生资金往来，既然是代理，所有资金都通过代理方走，这样方便。
海关方面，虽然有规定进口货物的收货人或办理报关手续的单位和个人，都可以成为进口货物的纳税义务人，但是在实际工作中，一般由进口代理者代缴进口环节增值税。纳税后，由代理者将已纳税款和进口货物价款费用等与委托方结算，由委托者承担已纳税款。
PS:海关也可以根据代理情况开具双抬头的专用缴款书。
外汇方面也有相关的要求，所以报关代理的“代收代付”情况不可回避的存在着。
四、代收代付的税收规定
财税 【2016】36号文《关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》附件1第三十七条规定：销售额，是指纳税人发生的应税行为取得的全部价款和价外费用，财政部和国家税务总局另有规定的除外。
《增值税暂行条例实施细则》第十二条，关于价外费用的规定如下：“条例第六条第一款所称价外费用，包括价外向购买方收取的手续费、补贴、基金、集资费、返还利润、奖励费、违约金、滞纳金、延期付款利息、赔偿金、代收款项、代垫款项、包装费、包装物租金、储备费、优质费、运输装卸费以及其他各种性质的价外收费。”
价外费用并入销售额，意图在于计税基数不被侵蚀，属于反避税条款。试想如果没有价外费用并入销售额的规定，纳税人将会钻空子，将销售额人为拆分为一项或者若干项价外收费项目逃避纳税义务。
代收代付行为等，从上述文件的形式上看属于增值税文件中的价外收费。
但是，在报关代理这个业务行为中，税人的意图不在于避税，属于正常经营活动的“必然”。（见第三条）。如果将此部分纳入增值税计税范围，就不符合事情，造成税收对经济的不当干预。
五、代理报关进口货物增值税问题
财税字[1994]26号财政部、国家税务总局关于增值税、营业税若干政策法规的通知第五条规定（并未失效，至少笔者没查到失效规定）
代购货物行为，从同时具备以下条件的，不征收增值税，不同时具备以下条件的，无论会计制度法规如何核算，均征收增值税。
（一）受托方不垫付资金；
（二）销货方将发票开具给委托方，并由受托方将该项发票转交给委托方；
（三）受托方按销售方实际收取的销售额和增值税额（如系代理进口货物则为海关代征的增值税额）与委托方结算货款，并另外收取手续费。
六、代理关键点
1、代理合同
2、资金绝对不能垫付，所谓垫付就是先付后收，一定要先收后付。
3、外商发票必须包含委托方名称。
4、按实际结算货款价，差额都归入手续费，按照本文（一）中的税目纳税。
七、账务处理
借：应收账款-代收部分（货款+税金）
应收账款-手续费部分
贷：主营业务收入-手续费
应交税费-应交增值税-销项税额（手续费部分、开具6%发票）
应付账款-代收部分（付外商+海关）