新一代京东云与部件厂商在规格定义、供应模式等多方面进行了定制合作。例如，与芯片厂商深度合作，通过早期联合定制等手段，使得京东云服务器的云实例承载能力比同价格的标准品提升2倍以上。
除此之外，第二代京东云服务器还采用了风液混合散热系统设计。通过液冷对处理器等高功耗模块散热，硬盘和IO卡等低功耗模块继续采用风冷散热。值得注意的是，风液混合散热系统不但可提高设备峰值性能，还可大幅提升系统的散热效能最多达50%。“硬盘前置，风扇后置”的系统架构也最大程度的拉开风扇和硬盘之间的距离，从而有效的降低对硬盘的影响。在与硬盘厂商的联合实验室测试中，这一设计可以显著降低磁盘的读写失误，从而显著提高磁盘性能。
部署方式上，第二代京东云沿用业内传统的19 英寸机柜标准设备宽度，柜内的各个节点独立散热，并且可以在集中供电、独立供电两种模式间，通过更换供电模块来灵活适配，从而实现了设备节点既能在定制机柜部署，也能放置于标准机柜部署。另外，设备节点的IO出线也采用了模块化设计。
由于是整机柜设计，第二代京东云服务器可以实现高效的“机柜+IT设备+线缆”整机柜一体化交付。免去了传统的机房部署，IT设备上架安装和机柜内布线这些需要耗费大量人力的环节。另外，通过整机柜设计中的集中供电架构以及节点内的能效架构优化，第二代京东云服务器的整体效能提升10%。