时间太久，不知道你解决了没有。
这个问题最新的SSR可以解决。SSR协议的安卓应用里面有分「应用代理」这个选项。
smartproxy / proxydroid
影梭不支持。不过你的SS服务器设计的好的话，比如自己的VPS，可以装上dnsmasq，把国内网站解析出国内ip。影梭支持根据ip地址判断直连或者走ss服务器，简单说就是支持国内走直连，国外走ss。如果服务器设计不好，把一些国内网站返回了国外的CDN的ip地址，你就会出去兜一圈。比如访问淘宝啥的，很可能返回了国际网站的地址，你的网页自动跑去国际淘宝的cdn地址去了。
app走代理不走不好确定吧
安卓5.0以上原生支持。。
PAC使用方法教程